Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UbdP63072 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UbdP63072 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UbdP63072 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UbdP63072 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UbdP63072 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UbdP63072 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms