Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab17P35292 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab17P35292 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms