Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF2P35240 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NF2P35240 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF2P35240 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NF2P35240 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NF2P35240 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NF2P35240 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NF2P35240 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NF2P35240 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NF2P35240 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NF2P35240 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NF2P35240 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NF2P35240 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NF2P35240 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NF2P35240 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NF2P35240 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NF2P35240 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NF2P35240 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NF2P35240 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NF2P35240 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NF2P35240 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF2P35240 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NF2P35240 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NF2P35240 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NF2P35240 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NF2P35240 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NF2P35240 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NF2P35240 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NF2P35240 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NF2P35240 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NF2P35240 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NF2P35240 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.8 ms