Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms