Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp23O88676 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms