Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WTIPA6NIX2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms