Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms