Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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USP18Q9UMW8 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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USP18Q9UMW8 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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USP18Q9UMW8 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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USP18Q9UMW8 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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USP18Q9UMW8 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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USP18Q9UMW8 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP18Q9UMW8 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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