Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GTF2H1-210ENST00000530496 1700 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC007848.1-201ENST00000538430 1405 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MIR30C1-201ENST00000385227 89 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 VN2R17P-201ENST00000391712 832 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR7E91P-201ENST00000400027 866 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL139274.1-201ENST00000402374 936 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC074117.1-203ENST00000412749 399 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 USP32P1-203ENST00000417524 1014 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 METTL8P1-201ENST00000428182 611 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC113208.1-201ENST00000497944 318 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC008592.1-201ENST00000503091 665 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC004477.2-201ENST00000583349 192 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC010320.1-201ENST00000599775 578 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL109933.4-201ENST00000612111 157 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC087742.2-201ENST00000616113 740 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CTSLP2-202ENST00000626319 1104 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC108724.2-201ENST00000634593 290 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 GLRA4-201ENST00000372617 1795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ALG8-221ENST00000615266 1469 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PCDH18-205ENST00000511115 1331 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FBXO9-203ENST00000370939 1580 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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