Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN11AQ9UI33 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms