Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms