Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms