Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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