Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx18Q91ZR2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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