Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfrp1Q8BXL7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms