Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Vipas39Q8BGQ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Vipas39Q8BGQ1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Vipas39Q8BGQ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vipas39Q8BGQ1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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