Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms