Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms