Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTBP1Q13363 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTBP1Q13363 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms