Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SP140Q13342 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SP140Q13342 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SP140Q13342 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SP140Q13342 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SP140Q13342 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SP140Q13342 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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SP140Q13342 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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SP140Q13342 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SP140Q13342 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SP140Q13342 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SP140Q13342 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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