Protein–RNA interactions for Protein: Q12505

SKS1, Serine/threonine-protein kinase SKS1, yeastyeast

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKS1Q12505 HTB2YBL002W 396 nt0.62□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 SGF11YPL047W 300 nt0.62□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 BIL1YOR304C-A 231 nt0.61□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 YPL225WYPL225W 441 nt0.61□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.6□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.6□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.6□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.6□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 YJL120WYJL120W 324 nt0.6□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 UTP20YBL004W 7482 nt0.6□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.59□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.59□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 TAR1YLR154W-C 375 nt0.59□□□□□ -2.31
SKS1Q12505 PRP16YKR086W 3216 nt0.59□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 LTE1YAL024C 4308 nt0.58□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 VAR1Q0140 1197 nt0.58□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 YGR035CYGR035C 351 nt0.57□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 ASE1YOR058C 2658 nt0.56□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 FYV10YIL097W 1551 nt0.55□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.55□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 SSS1YDR086C 243 nt0.54□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 YDR157WYDR157W 402 nt0.54□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.54□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 SEC8YPR055W 3198 nt0.54□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 YDR048CYDR048C 315 nt0.53□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 QCR9YGR183C 201 nt0.53□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 PAU12YGR294W 363 nt0.53□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.53□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.53□□□□□ -2.32
SKS1Q12505 YMR321CYMR321C 318 nt0.52□□□□□ -2.33
SKS1Q12505 COX5BYIL111W 456 nt0.51□□□□□ -2.33
SKS1Q12505 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.5□□□□□ -2.33
SKS1Q12505 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.5□□□□□ -2.33
SKS1Q12505 PET111YMR257C 2403 nt0.5□□□□□ -2.33
SKS1Q12505 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.49□□□□□ -2.33
SKS1Q12505 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.49□□□□□ -2.33
SKS1Q12505 SBH1YER087C-B 249 nt0.47□□□□□ -2.33
SKS1Q12505 snR190snR190 190 nt0.47□□□□□ -2.33
SKS1Q12505 PRP5YBR237W 2550 nt0.47□□□□□ -2.33
SKS1Q12505 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.46□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 YOL014WYOL014W 375 nt0.46□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 COG8YML071C 1824 nt0.45□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 OST4YDL232W 111 nt0.45□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.45□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 ULP2YIL031W 3105 nt0.45□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 RPS27BYHR021C 249 nt0.44□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 PRP42YDR235W 1635 nt0.44□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 VIK1YPL253C 1944 nt0.44□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 FMP27YLR454W 7887 nt0.43□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.43□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.42□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.42□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.42□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 CSE2YNR010W 450 nt0.41□□□□□ -2.34
SKS1Q12505 HAL9YOL089C 3093 nt0.4□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 MLP1YKR095W 5628 nt0.39□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 YKL136WYKL136W 399 nt0.39□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 BEM3YPL115C 3387 nt0.39□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 TRS65YGR166W 1683 nt0.37□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 snR60snR60 104 nt0.37□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 AI1Q0050 2505 nt0.37□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.36□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 YOR345CYOR345C 351 nt0.36□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 YSP1YHR155W 3687 nt0.35□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.35□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 YLR282CYLR282C 342 nt0.35□□□□□ -2.35
SKS1Q12505 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.34□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.34□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 ABF2YMR072W 552 nt0.33□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 YAF9YNL107W 681 nt0.33□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 YPR092WYPR092W 306 nt0.33□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 COY1YKL179C 2040 nt0.33□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 YFL019CYFL019C 354 nt0.31□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 YIL032CYIL032C 357 nt0.31□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 NNF2YGR089W 2811 nt0.31□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 HTL1YCR020W-B 237 nt0.3□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 ULI1YFR026C 510 nt0.3□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.3□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 YDR102CYDR102C 333 nt0.29□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 MLP2YIL149C 5040 nt0.28□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.28□□□□□ -2.36
SKS1Q12505 IQG1YPL242C 4488 nt0.27□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 YCR022CYCR022C 345 nt0.27□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.27□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 YPR197CYPR197C 564 nt0.27□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 ORC3YLL004W 1851 nt0.27□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 MYO1YHR023W 5787 nt0.26□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.26□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.26□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 BLI1YKL061W 342 nt0.26□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.26□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 YPR012WYPR012W 255 nt0.26□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 BIR1YJR089W 2865 nt0.26□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.25□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 RPS26AYGL189C 360 nt0.24□□□□□ -2.37
SKS1Q12505 YGL149WYGL149W 306 nt0.23□□□□□ -2.37
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