Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 IQG1YPL242C 4488 nt0.32□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.31□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YLR202CYLR202C 327 nt0.31□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YBR285WYBR285W 435 nt0.31□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 FMP27YLR454W 7887 nt0.31□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 PRP5YBR237W 2550 nt0.3□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.3□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YER079WYER079W 633 nt0.3□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YJL120WYJL120W 324 nt0.3□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YJR157WYJR157W 363 nt0.3□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 PRM3YPL192C 402 nt0.3□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 SEC8YPR055W 3198 nt0.29□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.29□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 VIK1YPL253C 1944 nt0.28□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 OST4YDL232W 111 nt0.28□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YHR138CYHR138C 345 nt0.28□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 Q0017Q0017 162 nt0.28□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 ULP2YIL031W 3105 nt0.27□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.27□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.27□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.27□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.27□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.27□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.27□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.27□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.27□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.27□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.26□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.26□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.26□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 PRP42YDR235W 1635 nt0.26□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 HAL9YOL089C 3093 nt0.26□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 AGA2YGL032C 264 nt0.25□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 snR190snR190 190 nt0.25□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.24□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 YOR121CYOR121C 306 nt0.24□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 UTP20YBL004W 7482 nt0.23□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 RPL35AYDL191W 363 nt0.23□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 SSS1YDR086C 243 nt0.23□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.23□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 YAR053WYAR053W 297 nt0.23□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 YNL324WYNL324W 396 nt0.23□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 YOR345CYOR345C 351 nt0.23□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.22□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 HTB2YBL002W 396 nt0.22□□□□□ -2.37
SNF8Q12483 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.2□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 TRS65YGR166W 1683 nt0.2□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 ORC3YLL004W 1851 nt0.2□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.19□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.19□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 LEE1YPL054W 906 nt0.19□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.18□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.18□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 YDR048CYDR048C 315 nt0.17□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.17□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.16□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 YPR092WYPR092W 306 nt0.16□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 ESP1YGR098C 4893 nt0.16□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 AI1Q0050 2505 nt0.16□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 BIR1YJR089W 2865 nt0.16□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 COG8YML071C 1824 nt0.15□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 NNF2YGR089W 2811 nt0.15□□□□□ -2.38
SNF8Q12483 RPS26AYGL189C 360 nt0.15□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.15□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 YKL136WYKL136W 399 nt0.14□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 YOL014WYOL014W 375 nt0.14□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.13□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 YLR282CYLR282C 342 nt0.13□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 BIL1YOR304C-A 231 nt0.13□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.13□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 ULI1YFR026C 510 nt0.12□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 YNL146WYNL146W 303 nt0.12□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 COY1YKL179C 2040 nt0.12□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 RCO1YMR075W 2055 nt0.11□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 QCR9YGR183C 201 nt0.11□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 RPS27BYHR021C 249 nt0.1□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.1□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 STE5YDR103W 2754 nt0.1□□□□□ -2.39
SNF8Q12483 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.08□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 YCR022CYCR022C 345 nt0.07□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 COX12YLR038C 252 nt0.07□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 NIP1YMR309C 2439 nt0.07□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 YGR035CYGR035C 351 nt0.06□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 CSE2YNR010W 450 nt0.06□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.05□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.04□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.04□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 snR60snR60 104 nt0.03□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.03□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.03□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.03□□□□□ -2.4
SNF8Q12483 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.01□□□□□ -2.41
SNF8Q12483 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.01□□□□□ -2.41
SNF8Q12483 BLI1YKL061W 342 nt0□□□□□ -2.41
SNF8Q12483 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0□□□□□ -2.41
SNF8Q12483 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.01□□□□□ -2.41
SNF8Q12483 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.02□□□□□ -2.41
SNF8Q12483 YKU70YMR284W 1809 nt-0.03□□□□□ -2.41
SNF8Q12483 SNU13YEL026W 381 nt-0.04□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YFL063WYFL063W 456 nt-0.04□□□□□ -2.42
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