Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms