Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 YJL120WYJL120W 324 nt0.07□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 YLR456WYLR456W 615 nt0.07□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 LEE1YPL054W 906 nt0.07□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 snR41snR41 95 nt0.07□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 YOR053WYOR053W 342 nt0.06□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 SGF11YPL047W 300 nt0.06□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 RPS26AYGL189C 360 nt0.05□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.05□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.05□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.04□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 snR190snR190 190 nt0.03□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 COY1YKL179C 2040 nt0.03□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 BUL2YML111W 2763 nt0.02□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 COX12YLR038C 252 nt0.02□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 RPS25BYLR333C 327 nt0.02□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 YLR434CYLR434C 384 nt0.02□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 YNL146WYNL146W 303 nt0.02□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 YPL068CYPL068C 882 nt0.02□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 YDL158CYDL158C 309 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 CSN9YDR179C 489 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 ATP19YOL077W-A 207 nt0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 NNF2YGR089W 2811 nt-0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 HMRA2YCR096C 360 nt-0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 HUG1YML058W-A 207 nt-0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 THO2YNL139C 4794 nt-0.01□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 NIP1YMR309C 2439 nt-0.02□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 SOV1YMR066W 2697 nt-0.02□□□□□ -2.41
YMR226CQ05016 ULI1YFR026C 510 nt-0.04□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 PCC1YKR095W-A 267 nt-0.04□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.04□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.05□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YCR022CYCR022C 345 nt-0.05□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-0.05□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 VPS20YMR077C 666 nt-0.05□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YPR092WYPR092W 306 nt-0.05□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YKU70YMR284W 1809 nt-0.08□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YEL073CYEL073C 324 nt-0.08□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YHR138CYHR138C 345 nt-0.08□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.08□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YOL014WYOL014W 375 nt-0.08□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 SSS1YDR086C 243 nt-0.09□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YAR029WYAR029W 225 nt-0.09□□□□□ -2.42
YMR226CQ05016 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-0.1□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.1□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YLR282CYLR282C 342 nt-0.1□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YNL303WYNL303W 348 nt-0.1□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.11□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 COG8YML071C 1824 nt-0.11□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.12□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.12□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-0.12□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 PRM3YPL192C 402 nt-0.12□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.13□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.13□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YLR232WYLR232W 348 nt-0.13□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 RPL35AYDL191W 363 nt-0.14□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YKL136WYKL136W 399 nt-0.14□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YLR041WYLR041W 321 nt-0.14□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.14□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 snR189snR189 189 nt-0.15□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 snR45snR45 172 nt-0.15□□□□□ -2.43
YMR226CQ05016 YER079WYER079W 633 nt-0.17□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 YER137W-AYER137W-A 306 nt-0.18□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.18□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 HTB2YBL002W 396 nt-0.19□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-0.2□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 YPL205CYPL205C 345 nt-0.2□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 SNU13YEL026W 381 nt-0.21□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.21□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 QCR9YGR183C 201 nt-0.22□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 RPS27BYHR021C 249 nt-0.22□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 YJL007CYJL007C 315 nt-0.22□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 YBR285WYBR285W 435 nt-0.22□□□□□ -2.44
YMR226CQ05016 snR8snR8 190 nt-0.23□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.23□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YFL063WYFL063W 456 nt-0.23□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YGR069WYGR069W 336 nt-0.23□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.23□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YOR121CYOR121C 306 nt-0.23□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YAR053WYAR053W 297 nt-0.24□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt-0.25□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YDR048CYDR048C 315 nt-0.26□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 snR128snR128 126 nt-0.26□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.27□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YDR366CYDR366C 399 nt-0.28□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 BLI1YKL061W 342 nt-0.28□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YKL063CYKL063C 504 nt-0.28□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.28□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.28□□□□□ -2.45
YMR226CQ05016 YDR210WYDR210W 228 nt-0.29□□□□□ -2.46
YMR226CQ05016 YLR202CYLR202C 327 nt-0.29□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.3 ms