Protein–RNA interactions for Protein: Q04623

ECM18, Protein ECM18, yeastyeast

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM18Q04623 YML002WYML002W 2214 nt0.55□□□□□ -2.32
ECM18Q04623 RPS25BYLR333C 327 nt0.55□□□□□ -2.32
ECM18Q04623 RPS30BYOR182C 192 nt0.55□□□□□ -2.32
ECM18Q04623 YJL120WYJL120W 324 nt0.54□□□□□ -2.32
ECM18Q04623 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.54□□□□□ -2.32
ECM18Q04623 CHS6YJL099W 2241 nt0.54□□□□□ -2.32
ECM18Q04623 YNL211CYNL211C 261 nt0.53□□□□□ -2.32
ECM18Q04623 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.52□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 YPL225WYPL225W 441 nt0.52□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.51□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 RPL26BYGR034W 384 nt0.51□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 ASE1YOR058C 2658 nt0.51□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 SGF11YPL047W 300 nt0.51□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 YDR048CYDR048C 315 nt0.5□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 SSS1YDR086C 243 nt0.5□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.5□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 TAR1YLR154W-C 375 nt0.5□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.49□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 INA22YIR024C 651 nt0.49□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 YFL019CYFL019C 354 nt0.48□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.48□□□□□ -2.33
ECM18Q04623 YMR321CYMR321C 318 nt0.46□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 FYV10YIL097W 1551 nt0.45□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.45□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.45□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.45□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 MLP1YKR095W 5628 nt0.44□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 SEC8YPR055W 3198 nt0.43□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 COG8YML071C 1824 nt0.43□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 ULP2YIL031W 3105 nt0.43□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.43□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 FMP27YLR454W 7887 nt0.43□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 PET111YMR257C 2403 nt0.43□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.42□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 COX5BYIL111W 456 nt0.42□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 YPR012WYPR012W 255 nt0.42□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.42□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 RPS27BYHR021C 249 nt0.41□□□□□ -2.34
ECM18Q04623 PRP5YBR237W 2550 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YAF9YNL107W 681 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 snR190snR190 190 nt0.4□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 SBH1YER087C-B 249 nt0.39□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 BEM3YPL115C 3387 nt0.39□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 snR60snR60 104 nt0.38□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 OST4YDL232W 111 nt0.38□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YDR102CYDR102C 333 nt0.38□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.38□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 CSE2YNR010W 450 nt0.38□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 VIK1YPL253C 1944 nt0.38□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YPR197CYPR197C 564 nt0.37□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 HAL9YOL089C 3093 nt0.37□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 MYO1YHR023W 5787 nt0.36□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 PRP42YDR235W 1635 nt0.36□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 BIR1YJR089W 2865 nt0.36□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YSP1YHR155W 3687 nt0.35□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 HTL1YCR020W-B 237 nt0.35□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 PAU12YGR294W 363 nt0.35□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.35□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.35□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.35□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.35□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 AI1Q0050 2505 nt0.34□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 MLP2YIL149C 5040 nt0.34□□□□□ -2.35
ECM18Q04623 YIL032CYIL032C 357 nt0.34□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YKL136WYKL136W 399 nt0.34□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 STE5YDR103W 2754 nt0.34□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.33□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 COY1YKL179C 2040 nt0.32□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YLR282CYLR282C 342 nt0.32□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YOR345CYOR345C 351 nt0.32□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 IQG1YPL242C 4488 nt0.31□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.31□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 snR36snR36 182 nt0.31□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YGL149WYGL149W 306 nt0.3□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.29□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.29□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 ULI1YFR026C 510 nt0.29□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 ABF2YMR072W 552 nt0.29□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YPR092WYPR092W 306 nt0.29□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 ATP6Q0085 780 nt0.28□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YFL063WYFL063W 456 nt0.28□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.28□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.28□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.28□□□□□ -2.36
ECM18Q04623 YNL028WYNL028W 318 nt0.27□□□□□ -2.37
ECM18Q04623 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.27□□□□□ -2.37
ECM18Q04623 TRS65YGR166W 1683 nt0.27□□□□□ -2.37
ECM18Q04623 YCR022CYCR022C 345 nt0.26□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.7 ms