Protein–RNA interactions for Protein: Q03530

RCE1, CAAX prenyl protease 2, yeastyeast

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RCE1Q03530 ESP1YGR098C 4893 nt0.21□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 YOR053WYOR053W 342 nt0.21□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 YPL068CYPL068C 882 nt0.21□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 YPL225WYPL225W 441 nt0.21□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 OST4YDL232W 111 nt0.2□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 YJL120WYJL120W 324 nt0.2□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 YOR345CYOR345C 351 nt0.2□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 PET111YMR257C 2403 nt0.2□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 MLP2YIL149C 5040 nt0.2□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 SPO21YOL091W 1830 nt0.2□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 BIR1YJR089W 2865 nt0.19□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 PAA1YDR071C 576 nt0.19□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.19□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.18□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 RPS25BYLR333C 327 nt0.18□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 BEM3YPL115C 3387 nt0.17□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.17□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 COX5BYIL111W 456 nt0.17□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 PCC1YKR095W-A 267 nt0.17□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 ORC3YLL004W 1851 nt0.17□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 VPS20YMR077C 666 nt0.17□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 HAL9YOL089C 3093 nt0.17□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 PRP42YDR235W 1635 nt0.16□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.16□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.16□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 VIK1YPL253C 1944 nt0.16□□□□□ -2.38
RCE1Q03530 SEC8YPR055W 3198 nt0.15□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 HMRA2YCR096C 360 nt0.15□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YER079WYER079W 633 nt0.15□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.15□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YAR029WYAR029W 225 nt0.15□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 LEE1YPL054W 906 nt0.14□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 PRM3YPL192C 402 nt0.14□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 snR190snR190 190 nt0.14□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.13□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.13□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YJL007CYJL007C 315 nt0.13□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.13□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 RCO1YMR075W 2055 nt0.12□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 SSS1YDR086C 243 nt0.12□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 STE5YDR103W 2754 nt0.11□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.11□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 RPS26AYGL189C 360 nt0.11□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YHR138CYHR138C 345 nt0.11□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.11□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YJR157WYJR157W 363 nt0.11□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.11□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.1□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 RPL35AYDL191W 363 nt0.1□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YPL205CYPL205C 345 nt0.1□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YBR285WYBR285W 435 nt0.1□□□□□ -2.39
RCE1Q03530 YPR092WYPR092W 306 nt0.09□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 THO2YNL139C 4794 nt0.09□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 ULI1YFR026C 510 nt0.08□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YNL146WYNL146W 303 nt0.08□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 COG8YML071C 1824 nt0.08□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.07□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.07□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.07□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 COY1YKL179C 2040 nt0.07□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 NNF2YGR089W 2811 nt0.07□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 AGA2YGL032C 264 nt0.06□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.06□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YOR121CYOR121C 306 nt0.06□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 BUL2YML111W 2763 nt0.05□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YKL063CYKL063C 504 nt0.05□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YLR202CYLR202C 327 nt0.05□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YAR053WYAR053W 297 nt0.05□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 HTB2YBL002W 396 nt0.05□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.05□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 NIP1YMR309C 2439 nt0.05□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YCR022CYCR022C 345 nt0.04□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YLR282CYLR282C 342 nt0.04□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.04□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.03□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 MLP1YKR095W 5628 nt0.03□□□□□ -2.4
RCE1Q03530 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.02□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 YDR048CYDR048C 315 nt0.01□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 YKL136WYKL136W 399 nt0.01□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 COX12YLR038C 252 nt0.01□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 SOV1YMR066W 2697 nt-0□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 YEL073CYEL073C 324 nt-0.02□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 RPS27BYHR021C 249 nt-0.02□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.02□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.02□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 YNL324WYNL324W 396 nt-0.02□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 Q0017Q0017 162 nt-0.02□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 snR45snR45 172 nt-0.03□□□□□ -2.41
RCE1Q03530 YKU70YMR284W 1809 nt-0.03□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.04□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-0.04□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 YLR041WYLR041W 321 nt-0.04□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.05□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.07□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 YGR069WYGR069W 336 nt-0.07□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.07□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 snR60snR60 104 nt-0.08□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 SNU13YEL026W 381 nt-0.08□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 YFL063WYFL063W 456 nt-0.08□□□□□ -2.42
RCE1Q03530 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 95.1 ms