Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx3P81067 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms