Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx4P70452 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx4P70452 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx4P70452 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms