Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP1P63208 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP1P63208 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP1P63208 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP1P63208 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms