Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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