Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ufm1P61961 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms