Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab17P35292 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms