Protein–RNA interactions for Protein: P32914

SPT4, Transcription elongation factor SPT4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4P32914 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.44□□□□□ -2.34
SPT4P32914 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.44□□□□□ -2.34
SPT4P32914 YMR321CYMR321C 318 nt0.44□□□□□ -2.34
SPT4P32914 HAL9YOL089C 3093 nt0.44□□□□□ -2.34
SPT4P32914 VAR1Q0140 1197 nt0.43□□□□□ -2.34
SPT4P32914 YSP1YHR155W 3687 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 YDR157WYDR157W 402 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 COX5BYIL111W 456 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 PRP5YBR237W 2550 nt0.41□□□□□ -2.34
SPT4P32914 SSS1YDR086C 243 nt0.4□□□□□ -2.35
SPT4P32914 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.4□□□□□ -2.35
SPT4P32914 MLP1YKR095W 5628 nt0.39□□□□□ -2.35
SPT4P32914 PET111YMR257C 2403 nt0.39□□□□□ -2.35
SPT4P32914 OST4YDL232W 111 nt0.38□□□□□ -2.35
SPT4P32914 YDR048CYDR048C 315 nt0.38□□□□□ -2.35
SPT4P32914 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.38□□□□□ -2.35
SPT4P32914 snR190snR190 190 nt0.38□□□□□ -2.35
SPT4P32914 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.37□□□□□ -2.35
SPT4P32914 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.37□□□□□ -2.35
SPT4P32914 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.37□□□□□ -2.35
SPT4P32914 PRP42YDR235W 1635 nt0.36□□□□□ -2.35
SPT4P32914 SBH1YER087C-B 249 nt0.36□□□□□ -2.35
SPT4P32914 PAU12YGR294W 363 nt0.36□□□□□ -2.35
SPT4P32914 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.36□□□□□ -2.35
SPT4P32914 VIK1YPL253C 1944 nt0.36□□□□□ -2.35
SPT4P32914 COG8YML071C 1824 nt0.36□□□□□ -2.35
SPT4P32914 IQG1YPL242C 4488 nt0.34□□□□□ -2.35
SPT4P32914 RPS27BYHR021C 249 nt0.34□□□□□ -2.36
SPT4P32914 CSE2YNR010W 450 nt0.32□□□□□ -2.36
SPT4P32914 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.31□□□□□ -2.36
SPT4P32914 INA22YIR024C 651 nt0.31□□□□□ -2.36
SPT4P32914 ABF2YMR072W 552 nt0.31□□□□□ -2.36
SPT4P32914 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.31□□□□□ -2.36
SPT4P32914 YMR160WYMR160W 2451 nt0.31□□□□□ -2.36
SPT4P32914 MLP2YIL149C 5040 nt0.3□□□□□ -2.36
SPT4P32914 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.29□□□□□ -2.36
SPT4P32914 YKL136WYKL136W 399 nt0.29□□□□□ -2.36
SPT4P32914 YOR345CYOR345C 351 nt0.29□□□□□ -2.36
SPT4P32914 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.28□□□□□ -2.36
SPT4P32914 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.28□□□□□ -2.36
SPT4P32914 YLR282CYLR282C 342 nt0.28□□□□□ -2.36
SPT4P32914 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.27□□□□□ -2.37
SPT4P32914 HTL1YCR020W-B 237 nt0.26□□□□□ -2.37
SPT4P32914 YCR022CYCR022C 345 nt0.25□□□□□ -2.37
SPT4P32914 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.25□□□□□ -2.37
SPT4P32914 FMP27YLR454W 7887 nt0.25□□□□□ -2.37
SPT4P32914 NNF2YGR089W 2811 nt0.24□□□□□ -2.37
SPT4P32914 snR60snR60 104 nt0.24□□□□□ -2.37
SPT4P32914 YFL019CYFL019C 354 nt0.24□□□□□ -2.37
SPT4P32914 YOR029WYOR029W 336 nt0.24□□□□□ -2.37
SPT4P32914 YDR102CYDR102C 333 nt0.23□□□□□ -2.37
SPT4P32914 ULI1YFR026C 510 nt0.23□□□□□ -2.37
SPT4P32914 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.23□□□□□ -2.37
SPT4P32914 COY1YKL179C 2040 nt0.23□□□□□ -2.37
SPT4P32914 YAF9YNL107W 681 nt0.22□□□□□ -2.37
SPT4P32914 YPR092WYPR092W 306 nt0.22□□□□□ -2.37
SPT4P32914 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.21□□□□□ -2.38
SPT4P32914 RPS26AYGL189C 360 nt0.21□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YIL032CYIL032C 357 nt0.21□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YPR012WYPR012W 255 nt0.21□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.2□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.2□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.2□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.2□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.2□□□□□ -2.38
SPT4P32914 UTP20YBL004W 7482 nt0.19□□□□□ -2.38
SPT4P32914 ULP2YIL031W 3105 nt0.19□□□□□ -2.38
SPT4P32914 BIR1YJR089W 2865 nt0.19□□□□□ -2.38
SPT4P32914 BLI1YKL061W 342 nt0.19□□□□□ -2.38
SPT4P32914 NIP1YMR309C 2439 nt0.18□□□□□ -2.38
SPT4P32914 ORC3YLL004W 1851 nt0.18□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YFL063WYFL063W 456 nt0.18□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.18□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YPR197CYPR197C 564 nt0.18□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.17□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YLR041WYLR041W 321 nt0.17□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YNL146WYNL146W 303 nt0.17□□□□□ -2.38
SPT4P32914 ESP1YGR098C 4893 nt0.16□□□□□ -2.38
SPT4P32914 RCO1YMR075W 2055 nt0.16□□□□□ -2.38
SPT4P32914 YGL149WYGL149W 306 nt0.15□□□□□ -2.39
SPT4P32914 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.15□□□□□ -2.39
SPT4P32914 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.15□□□□□ -2.39
SPT4P32914 YNL028WYNL028W 318 nt0.15□□□□□ -2.39
SPT4P32914 RPS30BYOR182C 192 nt0.15□□□□□ -2.39
SPT4P32914 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.13□□□□□ -2.39
SPT4P32914 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.13□□□□□ -2.39
SPT4P32914 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.13□□□□□ -2.39
SPT4P32914 snR36snR36 182 nt0.13□□□□□ -2.39
SPT4P32914 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.12□□□□□ -2.39
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