Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms