Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpcP21841 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SftpcP21841 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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