Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
F11rO88792 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
F11rO88792 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
F11rO88792 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
F11rO88792 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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