Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms