Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms