Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms