Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms