Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms