Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Pfdn1Q9CWM4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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