Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms