Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms