Protein–RNA interactions for Protein: Q921I9

Exosc4, Exosome complex component RRP41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc4Q921I9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc4Q921I9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms