Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms