Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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