Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pja2Q80U04 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms