Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms