Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf149Q3U2C5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf149Q3U2C5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf149Q3U2C5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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